Быстрое исследование ДНК вскоре может стать банальной медицинской процедурой

20-02-2014

Гонка за дешевеньким и резвым чтением людского генома, похоже, приближается к финишу. Сходу две личные компании в США заявили о том, что уже в этом году выпустят на рынок устройства, способные всего за тыщу баксов и один денек выдать полный текст нуклеотидной последовательности ДНК.

Научное общество, вобщем, глядит на эти обещания с некой толикой скепсиса.
Еще 10 годов назад полное чтение генома человека было научным мегапроектом, окончание которого по праву признали одним из более важных результатов 2003 года.

В-третьих, массовое прочтение генома поможет ученым самых разных специальностей — медики смогут лучше разобраться в причинах многофакторных заболеваний (шизофрении, например), а антропологи — детально восстановить историю того или иного народа.
Калифорнийская компания Life Technologies, уже выпускающая оборудование для секвенирования ДНК, заявила о планах по производству нового прибора Ion Proton, который сможет осуществить прочтение генома за сумму в 1 тыс. долл. и одни сутки.

А ее конкуренты в лице уже прочно обосновавшейся на рынке Illumina анонсировали выход HiSeq 2500 — устройства, которое может быть как приобретено отдельно, так и получено путем модернизации ранее вышедшей на рынок модели HiSeq 2000.
Столь оптимистичные прогнозы, впрочем, вызвали некоторое недоумение у отдельных экспертов.

Например, Исаак Ро, аналитик банка Goldman Sachs, отмечает, что один лишь используемый для секвенирования ДНК биочип Proton II сейчас обходится в тысячу долларов, так что для снижения цены секвенирования в целом — с реактивами, амортизацией оборудования и зарплатой лаборантов — компании Life Technologies придется очень постараться.
Аналогичные препятствия стоят перед их соперниками, но у Illumina есть бонус: оборудование этой компании уже стоит в почти всех лабораториях и его модернизация, обещанная фирмой за сравнительно скромные 50 тыс. долл., окажется привлекательней, чем покупка нового устройства за 244 тыс. от Life Technologies.

Дешевое прочтение генома важно по нескольким причинам.
Во-первых, знание набора доставшихся человеку генов позволяет лучше оценить риски развития того или иного заболевания.

Во-вторых, некоторые варианты генов могут определять не только лишь риск болезней, да и тяжесть побочных эффектов от лекарств или эффективность препаратов. На работу у генетиков, профессионалов по молекулярной биологии и представителей еще целого ряда специальностей ушло 13 лет, при этом правительство США издержало на финансирование проекта 3 миллиардов долл.

Коммерческая группа Крейга Вентера, известного спеца в области биотехнологии, совладала за наименьшее время и сумму в 10 раз меньше, да и 300 млн за пару лет тоже очевидно не были доступны всем желающим. Группа Вентера прочитала геном человека резвее и дешевле не просто за счет наилучшей организации, да и за счет технологического прогресса.

Устроители как коммерческого, так и муниципального проекта понимали, что вместе с самой последовательностью нуклеотидных пар их детища дадут населению земли и новые способы анализа генома, которые будут резвее и дешевле. А это в свою очередь приведет к началу совсем новейшей эры как минимум в науке и медицине.

Уже посреди нулевых годов стало возможным говорить о проектах по прочтению генома представителей той или иной национальности, о расшифровке полного генома неандертальца и о поиске ответственных за те или иные заболевания генов путем последовательного анализа геномов сразу многих людей.
Сейчас, в январе 2012 года, можно довольно уверено говорить о преодолении отметки в 10 тыс. долл. за полное прочтение индивидуального генома, и цены продолжают падать.Кто победит в гонке, пока неясно.

Но уже очевидно, что до взятия порога в 1 тыс. долл. и одни сутки осталось немного: если его не преодолеют в этом году, то возьмут в следующем. Гонка за скоростным прочтением генома окончательно перешла из научно-фундаментальной колеи на коммерческие рельсы, так что уже к концу этого десятилетия полное прочтение ДНК может стать пусть дорогим, но рутинным медицинским анализом.
Медицина 2.0 (www.med2.ru)

Читайте также: