Молекулярные «фильмы» могут ускорить разработку лекарств от рака

Эпигенетика занимается исследованием регуляции экспрессии генов методом модификации эпигенома – слоя хим меток, покрывающего ДНК и помогающего найти активность определенных генов.

Метилирование ДНК и гистонов происходит в эпигеноме и приводит к выключению неких критичных генов при раковой трансформации. Ингибирование этого механизма при помощи фармацевтических препаратов может вернуть экспрессию покоробленных генов и перепрограммировать поведение раковых клеток, возвратить их под контроль организма.

В отличие от обычных химиотерапевтических препаратов, эпигенетические средства не оказывают влияние на ДНК здоровых клеток, что делает их очень многообещающим для понижения побочных эффектов химиотерапии. Для сотворения эпигенетических препаратов нужно точно знать динамическую структуру молекул белков-целей и самих фармацевтических средств, что очень трудно сделать, имея только статические изображения.

Понимание изменений, происходящих в конформации комплекса LSD1/CoREST, может способствовать разработке эпигенетических препаратов.
Исследователи из фармацевтического колледжа университета штата Юта разработали компьютерный симулятор молекулярной динамики LSD1/CoREST на основе имеющихся данных рентгеноструктурного анализа, эффективно трансформирующий статическое изображения комплекса в видеофильм.

В несвязанном виде «рукоятки зажима» LSD1/CoREST вращаются, переходя из открытой в закрытую конфигурацию и наоборот.LSD1/CoREST представляет собой белковый комплекс, участвующий в эпигенетических конфигурациях. Экспрессия гена LSD1 повышена при многих видах рака.

Недавнешние исследования проявили, что LSD1-CoREST является связующим партнером для различных белков, участвующих в регуляции генов и изменении хроматина (комбинации ДНК и ДНК-упаковывающих белков-гистонов, а именно H3) клеточного ядра . Комплекс функционирует, как крошечный аллостерический зажим, который может обратимо открываться и закрываться, подстраиваясь под размеры партнеров. При связывании с гистоном H3 вращение существенно замедляется, что объясняет способность LSD1/CoREST связываться с таким широким кругом партнеров и может иметь отношение к ремоделированию хроматина.

Новая технология позволит эффективно провести скрининг крупных библиотек химических соединений и идентифицировать молекулы, наиболее подходящие для подавления эпигенетических целей.
Медицина 2.0 (www.med2.ru)

Читайте также:

Костный мозг из плаценты – новая надежда для онкобольных
13-01-2014

Стволовые клеточки, приобретенные из плаценты, способны посодействовать безнадёжным нездоровым....

Вещество, содержащееся в зеленом чае эффективно борется с раковыми клетками
30-10-2013

Ученые считают, что хим вещество, находящееся в зеленоватом чае, может быть применено для...

Американский школьник создал новый супертест для диагностики рака
30-07-2013

Новый тест для обнаружения рака сделал южноамериканский ребенок - 15-летний школьник Джек...

Противогрибковый препарат оказался средством от рака
05-11-2012

Южноамериканские ученые выявили противораковые характеристики у лекарства, которое употребляется...

Жареное красное мясо повышает риск развития рака простаты
03-09-2013

Нередкое потребление жареного красноватого мяса увеличивает риск развития рака предстательной...