Новый алгоритм секвенирования: 90% генов из одной клетки

Разработанный учеными метод улучшает производительность ПО, применяемого для отображения последовательности ДНК из одной бактериальной клеточки, тем позволяя захватить до 90% генов.
Новый алгоритм захватывает 90 % генов из одной клетки.

Это, конечно не 100 %, но уже сравнимо с современными технологиями секвенирования, которые захватывают 95 % генов из миллиардов культивируемых клеток.
Бактерии играют важную роль в здоровье человека.

Они составляют около 10% веса тела человека.Открытие дозволит исследователям собрать фактически полный портрет ДНК всего из одной бактериальной клеточки. Это прибыльно отличает новейшую методику от обычных способов секвенирования, которые требуют само мало миллиард идентичных клеток, выращенных в лабораторных культурах.

Исследование открывает двери для секвенирования бактерий, которые невозможно культивировать, а это львиная доля бактерий, живущих на нашей планете.
Ученые разработали алгоритм, который значительно улучшает производительность программного обеспечения, используемого для отображения последовательности ДНК из одной бактериальной клетки.Ученые из Института Дж.

Крейга Вентера разработали новый способ секвенирования и анализа «темной материи» жизни — геномов тыщ видов микробов, которые были ранее недосягаемы для генетического анализа. В эту группу входят мельчайшие организмы, производящие лекарства, биотопливо, также бактерии, живущие в человеческом организме.

Копирование ДНК представляет сложную задачу, поскольку некоторые гены необходимо копировать тысячу раз, а некоторые всего несколько. Современные алгоритмы не способны справиться с этими различиями и имеют тенденцию отбраковывать участки генома, скопированные пару раз, хотя они и могут стать ключом к секвенированию генома.

Новый алгоритм сохраняет эти части генома и использует их для более качественной расшифровки последовательности ДНК.
В процессе тестирования новой методики, ученые успешно расшифровали последовательность ДНК одной клетки кишечной палочки и восстановили 91% ее генов.

Некоторые из них, например, кишечная палочка, могут нанести ущерб здоровью, а другие помогают нам переваривать пищу.
Для изучения ДНК этих микроорганизмов требуется вырастить культуру бактерий, однако большинство микробов (по некоторым оценкам до 99 %) невозможно вырастить в лаборатории, поскольку они живут в строго определенных условиях и средах, например, в симбиозе с другими бактериями или на коже животного.

Новая технология секвенирования позволяет решить эту проблему, копируя геном одной бактериальной клетки до миллиарда раз.Новая технология позволит ответить на многие важные вопросы биологи, например, изучить природные антибиотики, которые производятся некоторыми бактериями. Также, впервые исследователи смогут выяснить, какие белки и пептиды бактерий, живущих в организме человека, используются микроорганизмами для связи вместе и хозяином.
Медицина 2.0 (www.med2.ru)

Читайте также:

Методика самарских врачей по спасению будущих детей
02-05-2013

Нередко дама воспринимает лекарства на ранешних сроках беременности, не зная о плоде. Жизненная...

Медицинская и лаболаторная мебель
04-02-2014

Современная медицина не обходится без всяческих приспособлений и устройств, в том числе и мед...

Протокол ведения нездоровых без седативных препаратов сокращает длительность пребывания на ИВЛ
09-10-2013

В отделениях реанимации и насыщенной терапии (ОРИТ) для облегчения проведения ИВЛ используют...

Влияние мебели из дерева на здоровье человека
29-10-2012

То, что различные виды деревьев не идиентично оказывают влияние на здоровье и самочувствие...

Арбитражный суд Республики Башкортостан вынес предупреждение ООО «ФармТехЦентр»
26-10-2012

Министерство здравоохранения Башкортостана обратилось в Арбитражный трибунал республики с...